Первые 1000 культивированных видов микробиоты человеческого желудочно-кишечного тракта

Микроорганизмы, обитающие в желудочно-кишечном тракте человека, представляют собой сложную экосистему с функциями, которые существенным образом вносят вклад в наш системный метаболизм и влияют на здоровье и заболевания. В связи с этим человеческая желудочно-кишечная микробиота была предметом обширных исследований. Несмотря на то, что значительная часть кишечных микроорганизмов ещё не культивирована, в настоящее время идентифицировано более 1000 различных микробных видов, способных обитать в желудочно-кишечном тракте человека. В этом обзоре представлен систематический обзор и подробные ссылки на в сумме 1057 кишечных видов Eukarya (92), Archaea (8) и Bacteria (957), основанные на филогенетической структуре их генов малой субъединицы рРНК. Кроме того, обзор объединяет сведения о распространённости, относительной численности, стабильности, физиологии, генетике и связи с состоянием здоровья человека этих желудочно-кишечных микроорганизмов, информация о которых в настоящее время разбросана по большому объёму литературы, опубликованной за последние 150 лет. Ожидается, что эти подробные физиологические и генетические данные будут способствовать углублению наших знаний о желудочно-кишечной микробиоте. Более того, они открывают пути для будущих сравнительных и функциональных метагеномных и других высокопроизводительных подходов, которым необходима систематическая и физиологическая основа для достижения значимого эффекта.