Роль нормальной кишечной микробиоты

Взаимосвязь между кишечной микробиотой и здоровьем человека привлекает всё большее внимание. В настоящее время хорошо установлено, что здоровая кишечная флора в значительной степени определяет общее состояние здоровья хозяина. Нормальная микробиота кишечника человека включает два основных типа (phylum): Bacteroidetes и Firmicutes. Хотя микробиота у младенца выглядит беспорядочной, она начинает напоминать взрослую флору примерно к трём годам. Тем не менее на протяжении всей жизни индивида существуют временные и пространственные вариации в распределении микроорганизмов от пищевода до прямой кишки. Развитие технологий геномного секвенирования и биоинформатики позволило детально изучать эти микроорганизмы, их функции и взаимодействия микроб — хозяин как в состоянии здоровья, так и при заболеваниях. Нормальная кишечная микробиота выполняет конкретные функции в метаболизме питательных веществ хозяина, в метаболизме ксенобиотиков и лекарств, в поддержании структурной целостности слизистой оболочки кишечника, в иммуномодуляции и в защите от патогенов. На формирование нормальной микробиоты влияют несколько факторов, включая (1) способ родоразрешения (вагинальные роды или кесарево сечение), (2) питание в детском возрасте (грудное молоко или смеси) и в зрелом возрасте (на растительной основе или на основе мяса), и (3) применение антибиотиков или антибиотикоподобных молекул, происходящих из окружающей среды или от комменсальных сообществ кишечника. Главная проблема при применении антибиотиков — это долгосрочные изменения здоровой кишечной микробиоты и горизонтальный перенос генов резистентности, что может привести к появлению резервоара организмов с пулом генов множественной лекарственной устойчивости.