Геномная последовательность клеточной линии яичника китайского хомячка (CHO)-K1

С 1987 года иммортализованные клетки яичника китайского хомячка используются для производства рекомбинантных лекарственных препаратов, включая моноклональные антитела, факторы крови, гормоны, факторы роста и ферменты. Xu и соавт. представляют последовательность генома предковой клеточной линии CHO-K1, которая должна способствовать оптимизации современных производственных клеточных линий. Клеточные линии, происходящие из яичника китайского хомячка (CHO), являются предпочтительными клетками-хозяевами для производства терапевтических белков. Здесь мы представляем черновую геномную последовательность предковой клеточной линии CHO-K1. Сборка включает 2,45 Гб геномной последовательности и 24 383 предсказанных гена. Для определения хромосомного расположения генов мы сопоставили большинство собранных скаффолдов с 21 хромосомой, выделенной с помощью микрофлюидики. Кроме того, мы исследовали гены, участвующие в гликозилировании, которое влияет на качество терапевтических белков, а также гены восприимчивости к вирусам, имеющие значение для клеточной инженерии и соблюдения нормативных требований. В геноме CHO-K1 присутствуют гомологи большинства генов человека, связанных с гликозилированием, однако 141 из этих гомологов не экспрессируется в условиях экспоненциального роста. Многие важные гены проникновения вирусов также присутствуют в геноме, но не экспрессируются, что может объяснять необычную устойчивость клеточных линий CHO к вирусам. Мы обсуждаем, как доступность этой последовательности генома может способствовать развитию геномных исследований для оптимизации производства биофармацевтических белков.