Хорошо регулируемый метод на основе электростатического потенциала с ограничением зарядов для вывода атомных зарядов: модель RESP
A well-behaved electrostatic potential based method using charge restraints for deriving atomic charges: the RESP model
1993-10-01
SCID: 54.1/xq3dkb3m
Discuss with AI
модель RESPатомные зарядыограничения зарядоввыведение атомных зарядовэлектростатический потенциал
Figures from the paper
Abstract (AI)
Представлен хорошо регулируемый метод вывода атомных частичных зарядов из электростатических потенциалов с использованием ограничений зарядов, обозначенный как модель RESP (Restrained ElectroStatic Potential). Подход подбирает атомные заряды таким образом, чтобы воспроизводить квантово-механически вычисленные электростатические потенциалы при наложении гиперболических ограничений для предотвращения нефизичных значений зарядов и повышения переносимости между конформациями и родственными молекулами. Метод решает проблемы плохо обусловленных задач и переобучения, возникающие при аппроксимации потенциалов, вычисленных в большом числе точек сетки, путем введения весов ограничений и объединения химически эквивалентных атомов. Приведены детали реализации, тесты на репрезентативных молекулах и сравнения с предыдущими методиками подбора, демонстрирующие, что RESP дает стабильные, химически осмысленные заряды, пригодные для использования в силовых полях молекулярной механики.
Key Findings
1
Ограничения зарядов повышают стабильность и физическую обоснованность получаемых атомных зарядов по сравнению с неподдерживаемыми ESP-приближениями.
2
Представлена модель RESP: метод на основе электростатического потенциала, получающий атомные заряды с помощью ограничений зарядов для получения корректных зарядов.
3
RESP даёт атомные заряды, пригодные для молекулярных симуляций, устраняя плохо обусловленность и переобучение при получении зарядов из ESP.
4
Метод предоставляет систематическую процедуру для получения переносимых и химически осмысленных частичных зарядов из квантовых электростатических потенциалов.
Research Object
Метод RESP (restrained electrostatic potential) для вычисления атомарных зарядов
Research Subject
Получение устойчивых и химически обоснованных частичных атомных зарядов на основе электростатического потенциала с применением ограничений зарядов (charge restraints)
Publication Details
Publication Date
1993-10-01
Journal
Publisher
ISSN
Access Type
Author Information
Download PDF
Subscribe to digest
Работы, цитирующие эту статью4
Структура дофаминового рецептора D3 в комплексе с карипразином раскрывает принципы создания частичных агонистов с заданными фармакологическими свойствами2026
Синтез, исследование поверхностной активности и молекулярно-динамическое моделирование катионного четвертичного аммониевого поверхностно-активного вещества2026
CP2K: программный пакет для расчетов электронной структуры и молекулярной динамики — Quickstep: эффективные и точные расчеты электронной структуры2020
Psi4 1.1: Открытая программа для расчёта электронной структуры с акцентом на автоматизацию, развитые библиотеки и интероперабельность2017