Хорошо регулируемый метод на основе электростатического потенциала с ограничением зарядов для вывода атомных зарядов: модель RESP

A well-behaved electrostatic potential based method using charge restraints for deriving atomic charges: the RESP model
Wendy D. Cornell, Piotr Cieplak, Peter A. Kollman, Christopher I. Bayly
1993-10-01

модель RESPатомные зарядыограничения зарядоввыведение атомных зарядовэлектростатический потенциал
Представлен хорошо регулируемый метод вывода атомных частичных зарядов из электростатических потенциалов с использованием ограничений зарядов, обозначенный как модель RESP (Restrained ElectroStatic Potential). Подход подбирает атомные заряды таким образом, чтобы воспроизводить квантово-механически вычисленные электростатические потенциалы при наложении гиперболических ограничений для предотвращения нефизичных значений зарядов и повышения переносимости между конформациями и родственными молекулами. Метод решает проблемы плохо обусловленных задач и переобучения, возникающие при аппроксимации потенциалов, вычисленных в большом числе точек сетки, путем введения весов ограничений и объединения химически эквивалентных атомов. Приведены детали реализации, тесты на репрезентативных молекулах и сравнения с предыдущими методиками подбора, демонстрирующие, что RESP дает стабильные, химически осмысленные заряды, пригодные для использования в силовых полях молекулярной механики.
1
Ограничения зарядов повышают стабильность и физическую обоснованность получаемых атомных зарядов по сравнению с неподдерживаемыми ESP-приближениями.
2
Представлена модель RESP: метод на основе электростатического потенциала, получающий атомные заряды с помощью ограничений зарядов для получения корректных зарядов.
3
RESP даёт атомные заряды, пригодные для молекулярных симуляций, устраняя плохо обусловленность и переобучение при получении зарядов из ESP.
4
Метод предоставляет систематическую процедуру для получения переносимых и химически осмысленных частичных зарядов из квантовых электростатических потенциалов.

Метод RESP (restrained electrostatic potential) для вычисления атомарных зарядов

Получение устойчивых и химически обоснованных частичных атомных зарядов на основе электростатического потенциала с применением ограничений зарядов (charge restraints)

Publication Details
Publication Date
1993-10-01
Journal
Publisher
ISSN
Access Type
Author Information
Authors
Wendy D. Cornell
Piotr Cieplak
Peter A. Kollman
Christopher I. Bayly
Explore further
Open the scid.ai AI chat with a ready-made request: it will find papers on a similar topic and help build a literature review.
Find similar papers in the chat
Make a presentation
100%