Ферменты, ассоциированные с вирионами и кодируемые бактериофагами, для преодоления углеводных барьеров в процессе инфекции

Бактериофаги — это вирусы бактерий, инфицирующие хозяев после успешного распознавания рецепторов и адсорбции на поверхности клетки. Необратимому прикреплению с последующим введением генома в цитоплазму клетки-хозяина должно предшествовать прохождение через разнообразные углеводные барьеры, такие как капсульные полисахариды (CPS), O-полисахаридные цепи молекул липополисахарида (LPS), внеклеточные полисахариды (EPS), формирующие матрикс биоплёнки, и слои пептидогликана (PG). Для этого бактериофаги оснащены различными углевод-активными ферментами, ассоциированными с вирионами, — полисахаридными деполимеразами и лизинами, которые распознают, связывают и разрушают полисахаридные соединения. Мы рассматриваем существующее разнообразие структурной локализации, вариабельной архитектуры, ферментативной специфичности и эволюционных аспектов полисахаридных деполимераз и лизинов, ассоциированных с вирионами (VAL), а также демонстрируем, как эти характеристики могут коррелировать с кругом хозяев. Кроме того, представлены методы определения их активности и потенциальные области применения этих ферментов в качестве антибактериальных и антивирулентных средств и диагностических инструментов.