Программное обеспечение для множественного выравнивания последовательностей MAFFT, версия 7: улучшения производительности и удобства использования

Представлено крупное обновление программы для множественного выравнивания последовательностей MAFFT. В эту версию включено несколько новых функций, в том числе возможность добавления невыровненных последовательностей в уже существующее выравнивание, коррекции направления при выравнивании нуклеотидных последовательностей, выполнения выравнивания с ограничениями и параллельной обработки; эти функции были реализованы после предыдущего крупного обновления. На конкретных примерах показано, как эти функции работают по отдельности и в сочетании друг с другом. Также приведены примеры некорректного выравнивания, выполненного MAFFT, чтобы прояснить ограничения программы. Обсуждаются способы предотвращения ошибочных выравниваний и текущие усилия по преодолению этих ограничений.