Анализ соматических piРНК у малярийного комара Anopheles coluzzii выявляет атипичные классы малых РНК, происходящих из генов

Малые РНК, взаимодействующие с белками PIWI (piРНК), играют ключевую роль в контроле активности транспозируемых элементов (ТЕ) в зародышевой линии животных. У различных видов членистоногих, включая комаров — переносчиков патогенов, путь piРНК также активен в соматических тканях, не относящихся к гонадам, где его мишени и функции изучены недостаточно. В настоящей работе исследованы особенности образования малых РНК в тканях головы и грудного отдела незаражённой лабораторной линии Anopheles coluzzii с акцентом на РНК длиной 24–32 нуклеотида. Малые РНК, происходящие из повторяющихся элементов, составляют небольшую долю, тогда как большинство малых РНК образуется из длинных некодирующих РНК (lncРНК) и матричных РНК генов, кодирующих белки. Большинство малых РНК, происходящих из повторяющихся элементов и lncРНК, обладали типичными признаками piРНК. Напротив, большинство малых РНК длиной 24–32 нуклеотида, происходящих из генов, кодирующих белки, не имели характерных признаков piРНК и демонстрировали признаки нетемплатного присоединения хвоста к 3′-концу. Большинство атипичных малых РНК характеризовались повышенной экспрессией у самок и происходили из митохондриальных и ядерных генов, участвующих в энергетическом обмене. Мы также выявили атипичные малые РНК, происходящие из генов, в соматических тканях Anopheles gambiae, что дополнительно подтверждает неканонический механизм их образования. Обсуждаются новый механизм образования малых РНК в соматических тканях комаров и возможное функциональное значение малых РНК, происходящих из генов.