Integrative Genomics Viewer (IGV): высокопроизводительная визуализация и исследование геномных данных

Визуализация данных является неотъемлемой частью анализа геномных данных. Вместе с тем объём и разнообразие наборов данных, создаваемых современными методами секвенирования и профильного анализа на чипах, представляют серьёзные трудности для инструментов визуализации. Integrative Genomics Viewer (IGV) — это высокопроизводительный просмотрщик, который эффективно обрабатывает большие гетерогенные наборы данных и при этом обеспечивает плавный и интуитивно понятный пользовательский опыт на всех уровнях разрешения генома. Важной характеристикой IGV является его ориентация на интегративный характер геномных исследований: поддержка как данных, полученных на микрочипах (array-based), так и данных секвенирования следующего поколения (next-generation sequencing), а также интеграция клинических и фенотипических данных. Хотя IGV часто используется для просмотра геномных данных из публичных источников, его основная цель — поддерживать исследователей, желающих визуализировать и исследовать собственные наборы данных или наборы данных коллег. В этой связи IGV поддерживает гибкую загрузку локальных и удалённых наборов данных и оптимизирован для обеспечения высокопроизводительной визуализации и исследования данных на стандартных настольных системах. IGV доступен для бесплатной загрузки по адресу http://www.broadinstitute.org/igv под лицензией GNU LGPL (открытое программное обеспечение).