Микробиом зубного налёта при здоровье и заболевании

Кариес зубов является одним из наиболее распространённых хронических заболеваний в мире. Различные факторы, включая микробные, генетические, иммунологические, поведенческие и средовые, взаимодействуют, способствуя возникновению и развитию кариеса зубов. В предыдущих исследованиях, посвящённых микробной основе кариеса зубов, были выявлены виды, ассоциированные как со здоровьем зубов, так и с заболеванием. Целью настоящего исследования было расширить представления о видах микроорганизмов, участвующих в развитии кариеса зубов и поддержании здоровья, посредством комплексного профилирования гена 16S рДНК микробиома зубного налёта у лиц без кариеса и с активным кариесом. Анализ более 50 000 почти полноразмерных клонов 16S рДНК позволил идентифицировать 1 372 операционные таксономические единицы (OTU) в микробиоме зубного налёта. Приблизительно половина OTU была общей для микробиомов лиц без кариеса и лиц с активным кариесом и присутствовала в сходной численности. Большинство различий между OTU отражало филотипы с очень низкой численностью. Это исследование позволило определить структуру популяции микробиома зубного налёта и выявить микробные сигнатуры, ассоциированные со здоровьем зубов и заболеванием. Глубокое профилирование зубного налёта позволило идентифицировать 87 филотипов, представленных в повышенной пропорции либо у лиц без кариеса, либо у лиц с активным кариесом. Среди этих сигнатур число ассоциированных со здоровьем зубов почти вдвое превышало число сигнатур, ассоциированных с кариесом зубов. Сопоставление этих данных с результатами других опубликованных исследований выявило значительную неоднородность результатов и показало, что для дальнейшего определения сигнатур возникновения и прогрессирования кариеса зубов могут потребоваться новые подходы.