Рамки исследований человеческого микробиома
A framework for human microbiome research
2012-06-01
SCID: 54.1/qc7nmnxx
Discuss with AI
16S рибосомальная РНКПроект человеческого микробиомапротоколы метагеномикиметагеномные последовательностиреферентные штаммы
Figures from the paper
Abstract (AI)
По всему человеческому телу существуют разнообразные микробные сообщества и их гены (микробиом), играющие фундаментальную роль в здоровье и заболеваниях человека. Консорциум проекта Human Microbiome Project, финансируемый Национальными институтами здравоохранения (NIH), разработал популяционно-ориентированную структуру для создания метагеномных протоколов, что привело к широкому набору контролируемых по качеству ресурсов и данных, включая стандартизованные методы создания, обработки и интерпретации различных типов высокопроизводительных метагеномных данных, доступных научному сообществу. В настоящей работе представлены ресурсы, полученные от популяции из 242 здоровых взрослых, у которых брали образцы с 15 или 18 участков тела до трех раз; в результате получено 5177 таксономических профилей микробов на основе генов 16S рибосомальной РНК и более 3,5 терабайт метагеномных последовательностей на данный момент. Параллельно последовательно секвенированы примерно 800 референтных штаммов, выделенных из человеческого тела. В совокупности эти данные представляют наибольший ресурс, описывающий разнообразие и распространённость человеческого микробиома, обеспечивая при этом основу для настоящих и будущих исследований.
Key Findings
1
Ресурсы собраны от 242 здоровых взрослых, взятых с 15 или 18 участков тела до трех раз, что привело к 5 177 таксономическим профилям по 16S рRNA.
2
Консорциум Human Microbiome Project создал популяционный фреймворк со стандартизированными метагеномными протоколами для исследований микробиома человека.
3
Проект сгенерировал более 3,5 терабайт метагеномных последовательностей и примерно 800 секвенированных референсных штаммов, выделенных из человеческого тела.
4
Эти объединенные наборы данных представляют собой крупнейший ресурс, описывающий распространённость и разнообразие микробиома человека, и предоставляют фреймворк для будущих исследований.
Research Object
Микробиом человека (микробные сообщества и их гены на различных участках тела человека)
Research Subject
Рамочная популяционная платформа и ресурсы для характеризования обилия, разнообразия и метагеномных профилей микробиома человека на различных участках тела
Publication Details
Publication Date
2012-06-01
Journal
Publisher
ISSN
Open access PDF
Access Type
Author Information
Download PDF
Subscribe to digest
Источники этой статьи в scid.ai3
Работы, цитирующие эту статью7
Интегративный проект по изучению микробиома человека2019
Временное развитие микробиоты кишечника в раннем детстве по данным исследования TEDDY2018
Здоровая микробиота человека2016
Кишечный микробиом в раннем возрасте: здоровье и болезни2014
Взаимоотношения совместного встречаемости микроорганизмов в микробиоме человека2012
Состав бактериального микробиома пищеварительного тракта у взрослых на основе образцов с семи поверхностей рта, миндалин, глотки и стула2012
Структура, функции и разнообразие микробиома здорового человека2012