PHENIX: комплексная система на базе Python для решения структур макромолекул
PHENIX: a comprehensive Python-based system for macromolecular structure solution
2012-02-27
SCID: 54.1/gp9pwxqs
Discuss with AI
PHENIXсистема на Pythonавтоматизированное решение структуравтоматизация кристаллографических алгоритмовмакромолекулярная рентгеновская кристаллография
Figures from the paper
Abstract (AI)
Макромолекулярная рентгеновская кристаллография регулярно применяется для понимания биологических процессов на молекулярном уровне. Тем не менее для решения и завершения многих таких структур по-прежнему требуется значительное время и усилия из-за необходимости ручной интерпретации сложных числовых данных с использованием множества программных пакетов и многократного применения интерактивной трехмерной графики. PHENIX разработан как комплексная система для решения структур макромолекулярной кристаллографии с упором на автоматизацию всех процедур. Это опирается на разработку алгоритмов, которые сводят к минимуму или устраняют субъективное вмешательство, разработку алгоритмов, автоматизирующих процедуры, традиционно выполняемые вручную, и, наконец, создание фреймворка, обеспечивающего тесную интеграцию между этими алгоритмами.
Key Findings
1
PHENIX автоматизирует процедуры, традиционно выполнявшиеся вручную, включая задачи, ранее требовавшие интерактивной 3D-графики и множества программ.
2
PHENIX делает упор на автоматизацию всех процедур, чтобы сократить время и ручной труд, необходимые для решения и завершения структур.
3
PHENIX реализует алгоритмы, которые минимизируют или устраняют субъективное вмешательство пользователя в рабочие процессы кристаллографии.
4
PHENIX — это комплексная система на Python для решения макромолекулярных кристаллографических структур, интегрирующая несколько алгоритмов и инструментов.
5
PHENIX предоставляет тесно интегрированную структуру, обеспечивающую плотное взаимодействие между автоматизированными алгоритмами и компонентами.
Research Object
PHENIX — комплексная система на Python для решения макромолекулярных кристаллических структур
Research Subject
Автоматизация и интеграция алгоритмов и процедур для решения структур в макромолекулярной рентгеновской кристаллографии с минимизацией субъективного ввода и заменой ручных интерактивных операций
Publication Details
Publication Date
2012-02-27
Journal
Publisher
ISSN
Open access PDF
Access Type
Author Information
Download PDF
Subscribe to digest