Высоко консервативный скрытый эпитоп в рецепторсвязывающих доменах SARS-CoV-2 и SARS-CoV

Вспышка коронавирусной болезни 2019 (COVID-19), вызванной тяжелым острым респираторным синдромом коронавирусом 2 (SARS-CoV-2), переросла в пандемию, однако в настоящее время мало что известно об антигенности вируса. Мы определили кристаллическую структуру CR3022, нейтрализующего антитела, ранее выделенного у реконвалесцента пациента с SARS, в комплексе с рецепторсвязывающим доменом (RBD) спайкового (S) белка SARS-CoV-2 с разрешением 3,1 ангстрема. CR3022 нацелено на высоко консервативный эпитоп, удаленный от сайта связывания рецептора, что обеспечивает кросс-реактивное связывание между SARS-CoV-2 и SARS-CoV. Структурное моделирование дополнительно показывает, что эпитоп доступен для связывания CR3022 только тогда, когда по крайней мере два RBD на тримерном S-белке находятся в «вверх» ("up") конформации и слегка повернуты. Эти результаты дают молекулярное представление о распознавании антителами SARS-CoV-2.