Единая генеалогия современных и древних геномов

Секвенирование современных и древних геномов со всего мира революционизировало наше понимание человеческой истории и эволюции. Тем не менее проблема наиболее адекватной характеристики предковых отношений на основе совокупности человеческой геномной вариации остаётся неразрешённой. В настоящей работе мы решаем эту задачу с помощью непараметрических методов, которые позволяют выводить единую генеалогию современных и древних людей. Эта компактная репрезентация нескольких наборов данных учитывает проблемы отсутствующих и ошибочных данных и использует древние образцы для ограничения и датировки связей. Мы демонстрируем способности метода восстанавливать отношения между отдельными индивидами и популяциями, а также идентифицировать потомков древних образцов. Наконец, мы представляем простой непараметрический оцениватель географического положения предков, который воспроизводит ключевые события в истории человечества.