clusterProfiler: пакет R для сравнения биологических тем среди кластеров генов

Рост объёмов количественных данных, получаемых в транскриптомике и протеомике, требует интегративных стратегий анализа. В настоящей работе мы представляем пакет R clusterProfiler, который автоматизирует процесс классификации биологических терминов и анализа обогащения кластеров генов. Модуль анализа и модуль визуализации объединены в повторно используемый рабочий процесс. В настоящее время clusterProfiler поддерживает три вида, включая человека, мышь и дрожжи. Методы, реализованные в пакете, могут быть легко расширены на другие виды и онтологии. Пакет clusterProfiler выпущен под лицензией Artistic-2.0 в рамках проекта Bioconductor. Исходный код и виньетка свободно доступны по адресу http://bioconductor.org/packages/release/bioc/html/clusterProfiler.html.