Bioconductor: открытая разработка программного обеспечения для вычислительной биологии и биоинформатики

Bioconductor: open software development for computational biology and bioinformatics
Jianhua Zhang, Rafael A. Irizarry, Jeff Gentry, Sandrine Dudoit, Jean Yang, Douglas M. Bates, Kurt Hornik, Cheng Li, Gordon K. Smyth, Wolfgang Huber, Colin A. Smith, Vincent J. Carey, Robert Gentleman, Ben Bolstad, Marcel Dettling, Byron Ellis, Laurent Gautier, Yongchao Ge, Torsten Hothorn, Stefano M. Iacus, Friedrich Leisch, Martin Maechler, Anthony Rossini, Günther Sawitzki, Luke Tierney
2004-09-15
SCID:  54.1/re6uh38x Discuss with AI
Bioconductorбиоинформатикавычислительная биологияразработка открытого программного обеспечениявоспроизводимые исследования
Abstract (AI)
Проект Bioconductor — это инициатива по совместной разработке расширяемого программного обеспечения для вычислительной биологии и биоинформатики. Цели проекта включают содействие совместной разработке и широкому использованию инновационного программного обеспечения, снижение барьеров для участия в междисциплинарных научных исследованиях и обеспечение воспроизводимости результатов исследований в удалённых вычислительных средах. Мы подробно описываем наши цели и методы, определяем текущие проблемы, сравниваем Bioconductor с другими открытыми биоинформатическими проектами и приводим рабочие примеры.
Key Findings
1
Одной из основных целей проекта является обеспечение удалённой воспроизводимости результатов исследований в вычислительной биологии.
2
Bioconductor — это совместная инициатива по разработке расширяемого программного обеспечения для вычислительной биологии и биоинформатики.
3
Bioconductor направлен на снижение барьеров для междисциплинарных научных исследований за счёт предоставления доступных вычислительных инструментов.
4
В статье описываются методы Bioconductor, текущие проблемы, сравнение с другими открытыми биоинформатическими проектами и практические примеры.
5
Проект стремится стимулировать разработку и широкое использование инновационного программного обеспечения посредством открытых совместных практик.
Research Object

Проект Bioconductor (расширяемое открытое программное обеспечение для вычислительной биологии и биоинформатики)

Research Subject

открытая совместная разработка и использование расширяемого программного обеспечения для вычислительной биологии и биоинформатики, включая воспроизводимость исследований

Publication Details
Publication Date
2004-09-15
Journal
Publisher
ISSN
Access Type
Author Information
Authors
Jianhua Zhang
Rafael A. Irizarry
Jeff Gentry
Sandrine Dudoit
Jean Yang
Douglas M. Bates
Kurt Hornik
Cheng Li
Gordon K. Smyth
Wolfgang Huber
Colin A. Smith
Vincent J. Carey
Robert Gentleman
Ben Bolstad
Marcel Dettling
Byron Ellis
Laurent Gautier
Yongchao Ge
Torsten Hothorn
Stefano M. Iacus
Friedrich Leisch
Martin Maechler
Anthony Rossini
Günther Sawitzki
Luke Tierney
Explore further
Open the scid.ai AI chat with a ready-made request: it will find papers on a similar topic and help build a literature review.
Find similar papers in the chat →
Make a presentation
100%