SpatialAgent: автономный AI-агент для пространственной биологии

SpatialAgent: An autonomous AI agent for spatial biology
Aviv Regev, Yichun He, Orit Rozenblatt‐Rosen, Jure Leskovec, Bo Li, Kexin Huang, Hanchen Wang, Ryan Copping, Chenyu Wang, Jin Liu, Lisa McGinnis, Bob Chen, Romain Lopez, Gabriele Scalia, Yong‐Ju Lee, Paula P. Coelho, Matthew Bucci, Abbas Nazir, Linh Trinh, Serena Zhang, Vineethkrishna Chandrasekar, Douglas Chung, Minsheng Hao, Ana Carolina Leote, Yong-Ju Lee, Tianyu Liu, Tawaun A. Lucas, Mingyu Ma, Nikita Makarov, Linna Peng, Stephen Ra, Avtar Singh, Liming Tao, Masatoshi Uehara, Runmin Wei, Matthew Bucci, Abbas Nazir, Ziyu Lu, Kexin Huang, Jin Liu, Lucas Tawaun, Lisa McGinnis, Avtar Singh
2025-04-06

ИИ-движимое открытиеSpatialAgentадаптивное рассуждениеавтономный ИИ-агентдинамическое выполнение инструментовпроектирование экспериментовчеловеческий мозгчеловеческое сердцегенерация гипотезlarge language modelsмодель колита толстой кишки мышимультимодальный анализ данныхпространственная биологиянабор данных из двух миллионов клеток
Прогресс в области искусственного интеллекта трансформирует научные открытия, однако пространственная биология, изучающая молекулярную организацию в тканях, по-прежнему ограничена трудоёмкими рабочими процессами. В настоящей работе мы представляем SpatialAgent — полностью автономный AI-агент, предназначенный для исследований в области пространственной биологии. SpatialAgent объединяет большие языковые модели с динамическим выполнением инструментов и адаптивным рассуждением. SpatialAgent охватывает весь исследовательский цикл: от проектирования экспериментов до многомодального анализа данных и генерации гипотез. Испытанный на нескольких наборах данных, включающих два миллиона клеток из человеческого мозга, сердца и модельного организма (мышиная колитная модель толстой кишки), SpatialAgent превзошёл лучшие вычислительные методы, сравнялся или превзошёл по ключевым задачам работающих учёных и масштабируемо работал в различных тканях и видах. Сочетая автономность с возможностью сотрудничества с человеком, SpatialAgent устанавливает новую парадигму AI-управляемых открытий в пространственной биологии.
1
Он интегрирует большие языковые модели с динамическим исполнением инструментов и адаптивным рассуждением для проектирования экспериментов, многомодального анализа данных и генерации гипотез.
2
SpatialAgent устанавливает парадигму, объединяющую автономность и сотрудничество с человеком для ИИ-управляемых открытий в пространственной биологии.
3
SpatialAgent — полностью автономный ИИ-агент, специально разработанный для исследований пространственной биологии и охватывающий весь исследовательский конвейер.
4
Производительность SpatialAgent превзошла лучшие вычислительные методы и соответствовала или превосходила людей-ученых в ключевых задачах.
5
Испытанный на наборах данных общей численностью два миллиона клеток из человеческого мозга, сердца и мышиной модели колита, SpatialAgent масштабируется по тканям и видам.

SpatialAgent — автономный ИИ-агент, разработанный для исследований в области пространственной биологии

Производительность и возможности агента в сквозном конвейере исследований пространственной биологии, включая проектирование экспериментов, анализ мультимодальных данных, генерацию гипотез и масштабирование по тканям и видам

Publication Details
Publication Date
2025-04-06
Journal
Publisher
ISSN
Cited by
49
Access Type
Author Information
Authors
Aviv Regev
Yichun He
Orit Rozenblatt‐Rosen
Jure Leskovec
Bo Li
Kexin Huang
Hanchen Wang
Ryan Copping
Chenyu Wang
Jin Liu
Lisa McGinnis
Bob Chen
Romain Lopez
Gabriele Scalia
Yong‐Ju Lee
Paula P. Coelho
Matthew Bucci
Abbas Nazir
Linh Trinh
Serena Zhang
Vineethkrishna Chandrasekar
Douglas Chung
Minsheng Hao
Ana Carolina Leote
Yong-Ju Lee
Tianyu Liu
Tawaun A. Lucas
Mingyu Ma
Nikita Makarov
Linna Peng
Stephen Ra
Avtar Singh
Liming Tao
Masatoshi Uehara
Runmin Wei
Matthew Bucci
Abbas Nazir
Ziyu Lu
Kexin Huang
Jin Liu
Lucas Tawaun
Lisa McGinnis
Avtar Singh
Explore further
Open the scid.ai AI chat with a ready-made request: it will find papers on a similar topic and help build a literature review.
Find similar papers in the chat
Make a presentation
100%