Банк данных белков RCSB: мощные новые инструменты для изучения трехмерных структур биологических макромолекул в фундаментальных и прикладных исследованиях и образовании в области фундаментальной биологии, биомедицины, биотехнологии, биоинженерии и энергетики

RCSB Protein Data Bank: powerful new tools for exploring 3D structures of biological macromolecules for basic and applied research and education in fundamental biology, biomedicine, biotechnology, bioengineering and energy sciences
Andrej Šali, Brian P. Hudson, Alexander Rose, David S. Goodsell, John Westbrook, S.K. Burley, Charmi Bhikadiya, Chunxiao Bi, Li Chen, Luigi Di Costanzo, Cole Christie, José M. Duarte, Shuchismita Dutta, Zukang Feng, Sutapa Ghosh, Rachel Kramer Green, Vladimir Guranović, Dmytro Guzenko, Yu‐He Liang, Robert Lowe, Ezra Peisach, Chris Randle, Monica Sekharan, Chenghua Shao, Yi‐Ping Tao, Maria Voigt, Jasmine Young, Christine Zardecki, Marina A. Zhuravleva, Yana Rose, Joan Segura, Sebastian Bittrich, Catherine L. Lawson, G.V. Crichlow, Kenneth Dalenberg, Sai J. Ganesan, Harry Namkoong, Irina Persikova
2020-11-17

3D-электронная микроскопия3D-структуры макромолекулRCSB Protein Data Bankбелки SARS-CoV-2макромолекулярная кристаллография
Банк данных белков Исследовательского консорциума по структурной биоинформатике (RCSB PDB), центр данных США глобального архива PDB и один из учредителей партнерства Worldwide Protein Data Bank, обслуживает десятки тысяч депонентов данных в Северной и Южной Америке и Океании и бесплатно и без ограничений предоставляет данные о трехмерных структурах макромолекул миллионам пользователей RCSB.org по всему миру, включая более 660 000 преподавателей, студентов и любознательных представителей широкой общественности, использующих PDB101.RCSB.org. Среди депонентов данных PDB — структурные биологи, применяющие макромолекулярную кристаллографию, спектроскопию ядерного магнитного резонанса, трехмерную электронную микроскопию и микроэлектронную дифракцию. К потребителям данных PDB, обращающимся к нашим веб-порталам, относятся исследователи, преподаватели и студенты, изучающие фундаментальную биологию, биомедицину, биотехнологию, биоинженерию и энергетические науки. В течение последних 2 лет ориентированный на исследовательскую работу веб-портал RCSB PDB (RCSB.org) был полностью переработан, что обеспечило улучшенный поиск с использованием полной логики булевых операторов и более удобный доступ к данным PDB, интегрированным с более чем 40 внешними ресурсами биоданных. Новые функции и ресурсы подробно описаны на примерах недавно опубликованных структур белков SARS-CoV-2 и белков клеток-хозяев, имеющих значение для понимания глобальной пандемии COVID-19 и борьбы с ней.
1
Новые возможности портала продемонстрированы на структурах белков SARS-CoV-2 и белков клеток-хозяев, имеющих значение для изучения и противодействия пандемии COVID-19.
2
Портал PDB101.RCSB.org обслуживает более 660 000 преподавателей, студентов и представителей широкой общественности, предлагая образовательные ресурсы по структурной биологии.
3
RCSB PDB предоставляет миллионам пользователей по всему миру бесплатный и неограниченный доступ к данным о трёхмерных структурах биологических макромолекул.
4
RCSB PDB поддерживает структуры, полученные методами кристаллографии, ядерного магнитного резонанса, трёхмерной электронной микроскопии и микроэлектронной дифракции.
5
Обновлённый портал RCSB.org поддерживает полнофункциональный поиск с логическими операторами Boolean и упрощает доступ к данным PDB, интегрированным более чем с 40 внешними биоинформационными ресурсами.

Банк данных о белках RCSB (RCSB PDB), его данные о трёхмерных структурах биологических макромолекул и веб-порталы

Новые инструменты и ресурсы для поиска, доступа, интеграции и изучения данных о трёхмерных структурах макромолекул в научных и образовательных целях

Publication Details
Publication Date
2020-11-17
Journal
Publisher
ISSN
Access Type
Author Information
Authors
Andrej Šali
Brian P. Hudson
Alexander Rose
David S. Goodsell
John Westbrook
S.K. Burley
Charmi Bhikadiya
Chunxiao Bi
Li Chen
Luigi Di Costanzo
Cole Christie
José M. Duarte
Shuchismita Dutta
Zukang Feng
Sutapa Ghosh
Rachel Kramer Green
Vladimir Guranović
Dmytro Guzenko
Yu‐He Liang
Robert Lowe
Ezra Peisach
Chris Randle
Monica Sekharan
Chenghua Shao
Yi‐Ping Tao
Maria Voigt
Jasmine Young
Christine Zardecki
Marina A. Zhuravleva
Yana Rose
Joan Segura
Sebastian Bittrich
Catherine L. Lawson
G.V. Crichlow
Kenneth Dalenberg
Sai J. Ganesan
Harry Namkoong
Irina Persikova
Explore further
Open the scid.ai AI chat with a ready-made request: it will find papers on a similar topic and help build a literature review.
Find similar papers in the chat
Make a presentation
100%