Комплексная характеристика генов и мутаций — драйверов рака
Comprehensive Characterization of Cancer Driver Genes and Mutations
2018-04-01
SCID: 54.1/z9r2ybq9
Discuss with AI
панраковый анализгены-драйверы ракаклинически значимые событиямутации-драйверыпрецизионная онкология
Figures from the paper
Abstract (AI)
Идентификация молекулярных драйверов рака имеет решающее значение для прецизионной онкологии. В настоящее время существует множество современных алгоритмов для выявления драйверов, однако систематических попыток объединить и оптимизировать их на больших наборах данных немного. Мы представляем анализ PanCancer и PanSoftware, охватывающий 9 423 экзома опухолей (включая все 33 проекта The Cancer Genome Atlas) и использующий 26 вычислительных инструментов для составления каталога генов и мутаций — драйверов рака. Мы выявили 299 генов-драйверов, что имеет значение для понимания их связи с анатомическими локализациями, а также типами рака и клеток. Анализ на основе последовательностей и структур выявил более 3 400 предполагаемых миссенс-мутаций-драйверов, подтвержденных несколькими независимыми линиями доказательств. Экспериментальная валидация подтвердила, что 60–85% предсказанных мутаций, вероятно, являются драйверными. Мы обнаружили, что более 300 MSI-опухолей связаны с высоким уровнем PD-1/PD-L1, а в 57% проанализированных опухолей присутствуют предположительно клинически значимые события. Наше исследование представляет собой наиболее комплексное на сегодняшний день выявление генов и мутаций — драйверов рака и послужит основой для будущих биологических и клинических исследований.
Key Findings
1
Панраковый и мультиинструментальный анализ 9 423 опухолевых экзомов из всех 33 проектов TCGA использовал 26 вычислительных инструментов для выявления драйверов рака.
2
Экспериментальная валидация показала, что 60–85% предсказанных мутаций, вероятно, являются драйверами рака.
3
Более 300 опухолей с микросателлитной нестабильностью характеризовались высокими уровнями PD-1/PD-L1, а 57% проанализированных опухолей содержали предполагаемые клинически значимые события.
4
Анализ последовательностей и структур выявил более 3 400 предполагаемых миссенс-мутаций-драйверов, подтверждённых несколькими независимыми линиями доказательств.
5
Исследование выявило 299 генов-драйверов и охарактеризовало их связи с анатомическими участками, типами рака и клеточными типами.
Research Object
Гены и мутации — драйверы рака — в опухолях из всех 33 проектов The Cancer Genome Atlas
Research Subject
Выявление и характеристика генов-драйверов и предполагаемых мутаций-драйверов, включая их связи с типом рака, анатомическим участком, молекулярными признаками и клинической применимостью
Publication Details
Publication Date
2018-04-01
Journal
Publisher
ISSN
Open access PDF
Access Type
Author Information
Download PDF
Subscribe to digest