PHENIX: комплексная система на основе Python для определения структуры макромолекул
PHENIX : a comprehensive Python-based system for macromolecular structure solution
2010-01-21
SCID: 54.1/zpqtu6y8
Discuss with AI
PHENIXкристаллографическое решение структурымакромолекулярная рентгеновская кристаллографияавтоматизация решения структурытрёхмерная графика
Figures from the paper
Abstract (AI)
Макромолекулярная рентгеновская кристаллография широко применяется для изучения биологических процессов на молекулярном уровне. Однако для определения и завершения многих таких структур по-прежнему требуются значительные время и усилия, поскольку необходимо вручную интерпретировать сложные числовые данные с использованием множества программных пакетов и неоднократно обращаться к интерактивной трёхмерной графике. Система PHENIX разработана как комплексная система для определения кристаллографической структуры макромолекул с акцентом на автоматизацию всех процедур. Это стало возможным благодаря разработке алгоритмов, минимизирующих или устраняющих необходимость субъективного ввода, алгоритмов автоматизации процедур, традиционно выполняемых вручную, и, наконец, программной среды, обеспечивающей тесную интеграцию этих алгоритмов.
Key Findings
1
Тесно интегрированная программная платформа объединяет разработанные алгоритмы в единую систему решения структур.
2
В PHENIX разработаны алгоритмы, минимизирующие или устраняющие субъективный ввод пользователя при кристаллографическом анализе.
3
PHENIX — это комплексная система на Python для решения макромолекулярных структур методом рентгеновской кристаллографии.
4
Система автоматизирует процедуры, традиционно выполнявшиеся вручную, включая интерпретацию сложных численных данных и многократное использование интерактивной трёхмерной графики.
5
Система ориентирована на автоматизацию всего рабочего процесса решения структур, сокращая время и усилия, необходимые для анализа сложных структур.
Research Object
Программная система PHENIX для решения макромолекулярной кристаллографической структуры
Research Subject
Автоматизация и интеграция процедур решения макромолекулярных кристаллографических структур для минимизации ручного и субъективного ввода
Publication Details
Publication Date
2010-01-21
Journal
Publisher
ISSN
Open access PDF
Access Type
Author Information
Download PDF
Subscribe to digest
Источники этой статьи в scid.ai1
Работы, цитирующие эту статью7
Синтез ДНК с динуклеотидными повторами по белковому шаблону обратной транскриптазой антивирусной системы2026
Редактирование генома хлоропластов Rubisco повышает фотосинтез и рост растений2025
FcRL4 — рецептор IgA, который преимущественно связывает соединительную цепь2026
Структурные основы сборки амилоидных фибрилл белками запаса семян растений2026
Структурная основа распознавания лизофосфатидной кислоты и нетипичного связывания с Gαq рецептором LPAR52026
Вычислительное проектирование и клеточный синтез двух топологических изомеров белка: соломонов узел и трёхкрутный узел2026
REFMAC5 для уточнения структур макромолекулярных кристаллов2011