PHENIX: комплексная система на основе Python для определения структуры макромолекул

PHENIX : a comprehensive Python-based system for macromolecular structure solution
Ralf W. Grosse‐Kunstleve, Paul D. Adams, Vincent B. Chen, Gary J. Kapral, Jane S. Richardson, Ian Davis, Randy J. Read, Jeffrey J. Headd, Nigel W. Moriarty, David Richardson, Pavel V. Afonine, Thomas C. Terwilliger, Airlie J. McCoy, G. Bunkóczi, Nathaniel Echols, Li‐Wei Hung, Robert D. Oeffner, Peter H. Zwart
2010-01-21

PHENIXкристаллографическое решение структурымакромолекулярная рентгеновская кристаллографияавтоматизация решения структурытрёхмерная графика
Макромолекулярная рентгеновская кристаллография широко применяется для изучения биологических процессов на молекулярном уровне. Однако для определения и завершения многих таких структур по-прежнему требуются значительные время и усилия, поскольку необходимо вручную интерпретировать сложные числовые данные с использованием множества программных пакетов и неоднократно обращаться к интерактивной трёхмерной графике. Система PHENIX разработана как комплексная система для определения кристаллографической структуры макромолекул с акцентом на автоматизацию всех процедур. Это стало возможным благодаря разработке алгоритмов, минимизирующих или устраняющих необходимость субъективного ввода, алгоритмов автоматизации процедур, традиционно выполняемых вручную, и, наконец, программной среды, обеспечивающей тесную интеграцию этих алгоритмов.
1
Тесно интегрированная программная платформа объединяет разработанные алгоритмы в единую систему решения структур.
2
В PHENIX разработаны алгоритмы, минимизирующие или устраняющие субъективный ввод пользователя при кристаллографическом анализе.
3
PHENIX — это комплексная система на Python для решения макромолекулярных структур методом рентгеновской кристаллографии.
4
Система автоматизирует процедуры, традиционно выполнявшиеся вручную, включая интерпретацию сложных численных данных и многократное использование интерактивной трёхмерной графики.
5
Система ориентирована на автоматизацию всего рабочего процесса решения структур, сокращая время и усилия, необходимые для анализа сложных структур.

Программная система PHENIX для решения макромолекулярной кристаллографической структуры

Автоматизация и интеграция процедур решения макромолекулярных кристаллографических структур для минимизации ручного и субъективного ввода

Publication Details
Publication Date
2010-01-21
Journal
Publisher
ISSN
Access Type
Author Information
Authors
Ralf W. Grosse‐Kunstleve
Paul D. Adams
Vincent B. Chen
Gary J. Kapral
Jane S. Richardson
Ian Davis
Randy J. Read
Jeffrey J. Headd
Nigel W. Moriarty
David Richardson
Pavel V. Afonine
Thomas C. Terwilliger
Airlie J. McCoy
G. Bunkóczi
Nathaniel Echols
Li‐Wei Hung
Robert D. Oeffner
Peter H. Zwart
Explore further
Open the scid.ai AI chat with a ready-made request: it will find papers on a similar topic and help build a literature review.
Find similar papers in the chat
Make a presentation
100%