Метод присоединения соседей: новый метод реконструкции филогенетических деревьев

Предлагается новый метод, называемый методом присоединения соседей, для реконструкции филогенетических деревьев по данным об эволюционных расстояниях. Принцип метода заключается в поиске пар операционных таксономических единиц (OTU [= соседей]), минимизирующих общую длину ветвей на каждом этапе кластеризации OTU, начиная со звездообразного дерева. С помощью этого метода можно быстро получить длины ветвей, а также топологию наиболее экономного дерева. Методом компьютерного моделирования изучена эффективность данного метода при получении правильного неукоренённого дерева в сравнении с пятью другими методами построения деревьев: методом невзвешенного попарного группирования, методом Фарриса, методом Саттата и Тверски, методом Ли и модифицированным методом Фарриса, предложенным Татэно и др. Показано, что новый метод присоединения соседей и метод Саттата и Тверски в целом превосходят остальные методы.