MEGA7: Molecular Evolutionary Genetics Analysis версия 7.0 для больших наборов данных
MEGA7: Molecular Evolutionary Genetics Analysis Version 7.0 for Bigger Datasets
2016-03-22
SCID: 54.1/hj2328xf
Discuss with AI
оптимизация для 64-битMEGA7Molecular Evolutionary Genetics Analysisавтоматическое предсказание дупликаций геновмастер построения временных деревьев
Figures from the paper
Abstract (AI)
Представлена последняя версия программного обеспечения Molecular Evolutionary Genetics Analysis (MEGA), содержащая множество сложных методов и инструментов для филогеномики и филомедицины. В этом крупном обновлении MEGA оптимизирована для использования на 64-битных вычислительных системах с целью анализа более крупных наборов данных. Исследователи теперь могут просматривать и анализировать десятки тысяч последовательностей в MEGA. Новая версия также предоставляет расширенный мастер для построения временных деревьев (timetrees) и включает новую функцию для автоматического прогнозирования событий дупликации генов в деревьях генных семейств. 64-битная MEGA доступна в двух интерфейсах: графическом и командной строки. Графический пользовательский интерфейс (GUI) является нативным приложением Microsoft Windows, которое также может использоваться на macOS. Командная версия MEGA доступна в виде нативных приложений для Windows, Linux и macOS. Они предназначены для использования в пакетной и скриптовой обработке. Обе версии доступны бесплатно с сайта www.megasoftware.net.
Key Findings
1
Обе версии MEGA7 доступны бесплатно на www.megasoftware.net для высокопроизводительных и сценарных (scripted) анализов.
2
MEGA7 добавляет автоматическое предсказание событий дупликации генов в древовидных семействах генов.
3
MEGA7 включает расширенного мастера (wizard) для построения временных деревьев, упрощающего анализ времени расхождения.
4
MEGA7 распространяется в виде графического нативного GUI для Windows (также используемого на Mac OS X) и командных нативных приложений для Windows, Linux и Mac OS X.
5
MEGA7 оптимизирован для 64-битных систем, что позволяет анализировать гораздо большие наборы данных, включая десятки тысяч последовательностей.
Research Object
Программное обеспечение Molecular Evolutionary Genetics Analysis (MEGA) версия 7.0
Research Subject
Масштабируемость и новые аналитические возможности для больших филогеномных наборов данных на 64‑битных системах, включая мастер для построения временных деревьев, автоматическое предсказание дупликаций генов в деревьях семейств генов и поддержка GUI/командной строки для высокопроизводительного использования
Publication Details
Publication Date
2016-03-22
Journal
Publisher
ISSN
Open access PDF
Access Type
Author Information
Download PDF
Subscribe to digest
Работы, цитирующие эту статью5
Семейство катионных переносчиков аминокислот/ассоциированных с гликопротеинами у zebrafish: последовательность и пространственно-временное распределение в развитии транспортной системы b0,+ (slc3a1/slc7a9)2021
На границе Европы и Азии: Gobio uralensis, новый вид пескарей (Cypriniformes, Gobionidae) из бассейна Каспийского моря2025
Динамика естественного и фармакологического контроля варианта SIV с дефектом траффикинга оболочки2025
Сезонные изменения структуры популяции кораллового жука Xylosandrus compactus и связанных с ним грибов в южном Средиземноморье2020
Амплификация почти полноразмерных провирусов HIV-1 для секвенирования следующего поколения2018