Репликация и активное распределение интегративных и конъюгативных элементов (ICE) семейства SXT/R391: граница между ICE и конъюгативными плазмидами становится всё тоньше

Replication and Active Partition of Integrative and Conjugative Elements (ICEs) of the SXT/R391 Family: The Line between ICEs and Conjugative Plasmids Is Getting Thinner
Vincent Burrus, Nicolas Carraro, Dominique Poulin
2015-06-10

интегративные и конъюгативные элементы SXT/R391репликация oriT, опосредованная TraIмножественная лекарственная устойчивостьстабилизация плазмидсистема партирования srpMRC
Интегративные и конъюгативные элементы (ICE) семейства SXT/R391 распространяют множественную лекарственную устойчивость среди патогенных гаммапротеобактерий, таких как Vibrio cholerae. ICE SXT/R391 представляют собой мобильные генетические элементы, локализованные в хромосоме хозяина и способные впоследствии самостоятельно передаваться другим бактериям посредством конъюгации. Конъюгативный перенос ICE SXT/R391 включает транзиторную внехромосомную кольцевую плазмидоподобную форму, которая, как предполагается, служит субстратом для транслокации одноцепочечной ДНК в клетку-реципиент через конъюгативную пору. Считается, что эта плазмидоподобная форма не реплицируется и поэтому должна быть крайне нестабильной. В настоящей работе мы показываем, что ICE R391 бактерии Providencia rettgeri не утрачивается при делении клеток. Мы исследовали генетические детерминанты, обеспечивающие стабильность R391. Во-первых, мы установили, что токсин-антитоксиновая система, подобная hipAB, повышает стабильность R391, поскольку её делеция приводила к десятикратному увеличению утраты R391. Поскольку hipAB не является консервативной особенностью ICE SXT/R391, мы искали альтернативные консервативные механизмы стабилизации. Мы обнаружили, что сама конъюгация не стабилизирует R391: делеция traG, устраняющая конъюгативный перенос, не влияла на частоту утраты. Однако делеция либо гена traI, кодирующего релаксазу, либо начала переноса (oriT) приводила к резкому увеличению утраты R391, коррелировавшему со снижением числа копий его плазмидоподобной формы. Это наблюдение указывает на то, что репликация, инициируемая TraI в oriT, необходима не только для конъюгативного переноса, но и для стабилизации ICE SXT/R391. Наконец, мы выявили консервативный локус srpMRC, кодирующий два белка, отдалённо родственных системе распределения parMRC плазмиды R1 II типа (АТФаза актинового типа). Анализы стабилизации R391 и плазмид показали, что srpMRC активен и способствует снижению утраты R391. Хотя системы распределения обычно стабилизируют плазмиды с низким числом копий, srpMRC является первой описанной системой, стабилизирующей...
1
Токсин-антитоксиновая система типа hipAB повышает стабильность R391; её удаление увеличивает потерю R391 в десять раз.
2
Стабильность R391 не зависит непосредственно от конъюгативной передачи, поскольку удаление traG не изменяет частоту потери элемента.
3
Интегративно-конъюгативный элемент R391 обладает высокой стабильностью в Providencia rettgeri и обычно не теряется при делении клеток-хозяев.
4
Консервативный локус srpMRC кодирует активную систему партиционирования, родственную ParMRC плазмиды R1, которая снижает потерю R391 и сближает ICE с конъюгативными плазмидами.
5
Релакса́за TraI и начало переноса oriT необходимы для стабилизации R391, вероятно благодаря репликации его плазмидоподобной формы, инициируемой TraI.

Интегративный и конъюгативный элемент R391 бактерии Providencia rettgeri, включая его временную внехромосомную плазмидоподобную форму

Зависимые от репликации и партиционирования механизмы стабилизации R391 и предотвращения его утраты при делении клеток

Publication Details
Publication Date
2015-06-10
Journal
Publisher
ISSN
Access Type
Author Information
Authors
Vincent Burrus
Nicolas Carraro
Dominique Poulin
Explore further
Open the scid.ai AI chat with a ready-made request: it will find papers on a similar topic and help build a literature review.
Find similar papers in the chat
Make a presentation
100%