Пептид слияния шипкового белка и вирулентность коронавирусов кошек

Коронавирусы хорошо известны своей способностью изменять тропизм к хозяину или тканям, что приводит к возникновению непредсказуемых новых заболеваний и изменениям патогенности; наиболее известными примерами являются тяжелый острый респираторный синдром и коронавирусы кошек соответственно. Коронавирусы кошек существуют в виде двух патотипов: невирулентных кишечных коронавирусов кошек (FECV), реплицирующихся в клетках кишечного эпителия, и летальных вирусов инфекционного перитонита кошек (FIPV), реплицирующихся в макрофагах. Имеющиеся данные указывают на то, что FIPV возникает из FECV в результате мутаций, однако устойчивые различия, позволяющие их разграничить, не установлены. Мы секвенировали полные геномы 11 вирусов каждого патотипа, а затем сосредоточились на одном наиболее различающемся участке, дополнительно секвенировав этот регион у сотен вирусов. В результате мы выявили два альтернативных аминокислотных различия в предполагаемом пептиде слияния шипкового белка, которые вместе позволяют отличить FIPV от FECV более чем в 95% случаев. По-видимому, благодаря этим и, возможно, другим мутациям вирус приобретает тропизм к макрофагам и распространяется системно.